El Arzobispo de Sevilla, Don Cristobal de Rojas y Sandoval, tío del Duque de Lerma, concibió el proyecto de dotar a Lerma de una Iglesia de grandes dimensiones y eligió la existente de San Pedro para la ampliación y reforma. El Duque continuó la obra emprendida, detándose de mayor amplitud, altitud y conservando las bóvedas de estilo gótico.

En el año 1603, el Papa Clemente VIII dispensó en Roma, La BUlla Primera de la Erección de la Iglesia Parroquial de San Pedre de Lerma en Colegiata.

Es de planta basilical con tres naves, con girola, trascoro y capillas absidiales.

En el interior destaca por su belleza y solemnidad la estatua orante del tío del Duque, Don Cristobal de Rojas y Sandoval realizada en bronce por Juan de Arfe y finalizada por Lesmes Fernández del Moral. También descatan los famosos órganos de 1612, construios por Diego de Quijano, Organero mayor de Felipe III. En la sacristía hay retratos del Duque, la cajonería de madera de nogal, cantorales, calvario y sobre todo, la preciosa mesa taraceada regalo del Papa Paulo V realizada con gusto oriental y técnica italiana.

El día 7 de octubre de 1617 se celebró con toda pompa y honores la traslación del Santísimo Sacramento a esta Iglesia Colegial.